Il MUFON nasce ufficialmente il 31 maggio 1969.
A quel tempo era conosciuto come UFO Network Midwest.
Diventato troppo grande per il solo confine degli stati del Midwest il nome fu cambiato in Mutual UFO Network, ora la più grande organizzazione di studio, investigazione e ricerca del fenomeno ufologico al mondo.
Allen Utke, Professore Associato di Chimica presso l'Università del Wisconsin fu il primo direttore del MUFON.
Un anno dopo Walter H. Andrus Jr., lo sostituì ed il suo incarico durò fino al 2000 quando si ritirò e John F. Schuessler prese il suo posto alla guida dell’organizzazione.
John si ritirò poi nel novembre 2006 e James Carrion divenne il nuovo Direttore Internazionale a cui seguì, alla fine del 2009, Clifford Clift.
Clift si dimise nel gennaio 2012 e David MacDonald ne divenne il successore.
Nel 2013, nel corso del symposium MUFON a Las Vegas, Jan Harzan divenne il nuovo Direttore Esecutivo.
Gli scopi del MUFON sono:
1) INDAGARE sugli avvistamenti UFO e raccogliere i dati in un database mondiale che sia di utilità per gli studiosi;
2) PROMUOVERE la ricerca sugli UFO per scoprire la vera natura del fenomeno, con un’ottica scientifica;
3) EDUCARE l’opinione pubblica sul fenomeno UFO e sul suo potenziale impatto sociale.
L’organizzazione conta oltre 3.000 membri in 40 diverse nazioni, la maggior parte dei quali negli Stati Uniti d’America, e la sua spina dorsale è costituita attualmente da oltre 600 investigatori accreditati (Field Investigator) che hanno seguito un corso di formazione e superato un esame, sulla base dell’apposito Field Investigator’s Manual (arrivato oggi alla quinta edizione).
Il Mutual UFO Network ha una propria rivista mensile (il MUFON UFO Journal), inviata a tutti gli iscritti, che ha superato i 600 numeri e pubblica indagini, ricerche e articoli, accessibile agli associati in forma elettronica o cartacea (quest’ultima con un modesto costo supplementare).
Dal 1970 il MUFON organizza un convegno annuale che fa il punto sulla ricerca ufologica con relatori da tutto il mondo.
L’associazione è gestita da un Consiglio Direttivo, il cui Direttore Esecutivo è attualmente David MacDonald che è tornato alla guida dell'organizzazione a seguito, nel luglio 2020, della sostituzione di Jan Harzan, coinvolto in una vicenda giudiziaria estranea alle attività istituzionali.
